Datrysiad diagnostig TB a DR -TB arloesol gan #Macro & Micro -test!

Arf newydd ar gyfer diagnosis twbercwlosis a chanfod gwrthiant cyffuriau: cenhedlaeth newydd wedi'i thargedu

Adroddiad Llenyddiaeth: CCA: Model diagnostig yn seiliedig ar TNGs a dysgu â pheiriant, sy'n addas ar gyfer pobl â llai o dwbercwlosis bacteriol a llid yr ymennydd twbercwlws.

Teitl y traethawd ymchwil: Dilyniant y genhedlaeth nesaf wedi'i dargedu â thiwbiau a dysgu â pheiriant: Strategaeth ddiagnostig ultra-sensitif ar gyfer tiwbiau ysgyfeiniol paucific a llid yr ymennydd tiwbaidd.

Cyfnodol: 《Clinica Chimica Acta》

Os ： 6.5

Dyddiad Cyhoeddi: Ionawr 2024

Ynghyd â Academi Gwyddorau Prifysgol Tsieineaidd ac Ysbyty Cist Beijing Prifysgol Feddygol Gyfalaf, Sefydlodd Macro a Micro-brawf fodel diagnosis twbercwlosis yn seiliedig ar y genhedlaeth newydd o dechnoleg dilyniannu wedi'i thargedu (TNGS) a dull dysgu peiriant, a ddarparodd uwch-uchel Roedd sensitifrwydd canfod ar gyfer twbercwlosis heb lawer o facteria a llid yr ymennydd twbercwlws, yn darparu dull diagnosis gorsensitifrwydd newydd Ar gyfer gwneud diagnosis clinigol o ddau fath o dwbercwlosis, a helpodd y diagnosis cywir, canfod gwrthiant cyffuriau a thrin twbercwlosis. Ar yr un pryd, darganfyddir y gellir defnyddio plasma cfDNA y claf fel math sampl addas ar gyfer samplu clinigol wrth wneud diagnosis o TBM.

Yn yr astudiaeth hon, defnyddiwyd 227 o samplau plasma a samplau hylif cerebrospinal i sefydlu dwy garfan glinigol, lle defnyddiwyd y samplau carfan diagnostig labordy i sefydlu'r model dysgu peiriant o ddiagnosis twbercwlosis, a defnyddiwyd y samplau carfan diagnostig clinigol i wirio i wirio Model Diagnostig. Targedwyd yr holl samplau yn gyntaf gan bwll stilio dal wedi'i dargedu'n arbennig ar gyfer twbercwlosis Mycobacterium. Yna, yn seiliedig ar ddata dilyniannu TB-TNGS, defnyddir y model coeden benderfynu i berfformio traws-ddilysu 5 gwaith ar setiau hyfforddi a dilysu'r ciw diagnostig labordy, a chafwyd trothwyon diagnostig samplau plasma a samplau hylif cerebrospinal. Mae'r trothwy a gafwyd yn cael ei ddwyn i mewn i ddwy set brawf o giw diagnosis clinigol i'w canfod, a chaiff perfformiad diagnostig y dysgwr ei werthuso gan gromlin ROC. Yn olaf, cafwyd y model diagnosis o dwbercwlosis.

Ffig. 1 Diagram sgematig o ddylunio ymchwil

Canlyniadau: Yn ôl trothwyon penodol sampl DNA CSF (AUC = 0.974) a sampl plasma cfDNA (AUC = 0.908) a bennwyd yn yr astudiaeth hon, ymhlith 227 o samplau, sensitifrwydd sampl CSF oedd 97.01%, y penodoldeb oedd 95.65%, a a Sensitifrwydd a phenodoldeb sampl plasma oedd 82.61% ac 86.36%. Yn y dadansoddiad o 44 sampl mewn parau o plasma cfDNA a DNA hylif cerebrospinal gan gleifion TBM, mae gan strategaeth ddiagnostig yr astudiaeth hon gysondeb uchel o 90.91% (40/44) mewn plasma cfDNA a DNA hylif cerebrospinal, a'r sensitifrwydd yw 95. (42/44). Mewn plant â thiwbercwlosis yr ysgyfaint, mae strategaeth ddiagnostig yr astudiaeth hon yn fwy sensitif i samplau plasma na chanlyniadau canfod Xpert samplau sudd gastrig gan yr un cleifion (28.57% o'i gymharu â 15.38%).

Ffig. 2 Dadansoddiad Perfformiad Model Diagnosis Twbercwlosis ar gyfer Samplau Poblogaeth

Ffig. 3 Canlyniadau diagnostig samplau pâr

Casgliad: Sefydlwyd dull diagnostig hypersensitif ar gyfer twbercwlosis yn yr astudiaeth hon, a all ddarparu teclyn diagnostig gyda'r sensitifrwydd canfod uchaf ar gyfer cleifion clinigol â thiwbercwlosis oligobacillary (diwylliant negyddol). Gall canfod twbercwlosis hypersensitif yn seiliedig ar plasma cfDNA fod yn fath sampl addas ar gyfer gwneud diagnosis o dwbercwlosis gweithredol a llid yr ymennydd twbercwlws (mae'n haws casglu samplau plasma na hylif serebro -sbinol ar gyfer cleifion a amheuir o dwbercwlosis yr ymennydd).

Dolen wreiddiol: https://www.scienceducrect.com/science/article/pii/s0009898123004990? trwy%3dihub

Cyflwyniad byr o gynhyrchion canfod cyfres twbercwlosis macro a micro-brawf

Yn wyneb sefyllfa sampl gymhleth cleifion twbercwlosis ac anghenion amrywiol, mae macro a micro-brawf yn darparu set gyflawn o atebion NGS ar gyfer echdynnu hylifedd o samplau crachboer, adeiladu a dilyniannu llyfrgell Qualcomm, a dadansoddi data. Mae'r cynhyrchion yn cwmpasu diagnosis cyflym o gleifion twbercwlosis, canfod gwrthiant cyffuriau o dwbercwlosis, teipio twbercwlosis mycobacterium a NTM, diagnosis gorsensitifrwydd o dwbercwlosis bacteria-negyddol a phobl dicion, ac ati.

Pecynnau Canfod Cyfresol ar gyfer Twbercwlosis a Mycobacteria:

Eitem Na	Enw'r Cynnyrch	Cynnwys Profi Cynnyrch	Math o sampl	Model cymwys
HWTS-3012	Asiant Rhyddhau Sampl	Fe'i defnyddir wrth drin hylifedd samplau crachboer, wedi sicrhau rhif cofnod o'r radd flaenaf, offer peiriannau Sutong 20230047.	grachgwn
HWTS-NGS-P00021	Pecyn Canfod Meintiau Qualcomm ar gyfer twbercwlosis hypersensitif (dull dal stiliwr)	Canfod gorsensitifrwydd anfewnwthiol (biopsi hylif) ar gyfer twbercwlosis ysgyfeiniol bacteria-negyddol a modiwlau ymennydd; Dadansoddwyd y samplau o bobl yr amheuir eu bod wedi'u heintio â thiwbercwlosis neu mycobacteria nad ydynt yn dwbercwlosis trwy metagenomeg dilyniannu dyfnder uchel, a chanfod gwybodaeth a oedd twbercwlosis neu mycobacteria nad ydynt yn dwberiwm yn cael eu heintio a'r prif wybodaeth gyffuriau llinell gyntaf yn cael eu heintio eu darparu.	Gwaed ymylol, hylif gollwng alfeolaidd, hydrothoracs ac asgites, sampl puncture ffocws, hylif cerebrospinal.	Ail genhedlaeth
HWTS-NGS-T001	Teipio mycobacterium a phecyn canfod gwrthiant cyffuriau (dull dilyniannu ymhelaethiad amlblecs)	Prawf teipio Mycobacterium, gan gynnwys MTBC a 187 NTM；Mae canfod gwrthiant cyffuriau o dwbercwlosis Mycobacterium yn gorchuddio 13 cyffur ac 16 safle treiglo craidd genynnau gwrthiant cyffuriau.	Crachboer, hylif gollwng alfeolaidd, hydrothoracs ac asgites, sampl puncture ffocws, hylif cerebrospinal.	Platfform deuol yr ail/drydedd genhedlaeth

Uchafbwyntiau: HWTS-NGS-T001 Pecyn Canfod Teipio Mycobacterium a Gwrthiant Cyffuriau (dull ymhelaethu amlblecs)

Cyflwyniad Cynnyrch

The product is based on the main first-and second-line drugs described in the WHO TB treatment guidelines, macrolides and aminoglycosides commonly used in the NTM treatment guidelines, and the drug resistance sites cover all one group of drug resistance-related sites in the PWY MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS Catalog treiglad cymhleth, yn ogystal â genynnau ymwrthedd cyffuriau a safleoedd treiglo eraill yr adroddir amdanynt yn ôl ymchwiliad ac ystadegau Llenyddiaethau â sgôr uchel gartref a thramor.

Mae teipio adnabod yn seiliedig ar y straenau NTM a grynhoir yng nghanllawiau NTM a gyhoeddwyd gan Chinese Journal of Tuberculosis a chlefydau anadlol a chonsensws arbenigwyr. Gall y primers teipio a ddyluniwyd ymhelaethu, dilyniant ac anodi mwy na 190 o rywogaethau NTM.

Trwy dechnoleg ymhelaethu PCR amlblecs wedi'i dargedu, ymhelaethwyd ar y genynnau genoteipio a genynnau sy'n gwrthsefyll cyffuriau o mycobacterium gan PCR amlblecs, a chafwyd y cyfuniad amplicon o enynnau targed i'w canfod. Gellir adeiladu'r cynhyrchion chwyddedig yn llyfrgelloedd dilyniannu trwybwn uchel yr ail genhedlaeth neu drydedd genhedlaeth, a gall yr holl lwyfannau dilyniant ail genhedlaeth a thrydedd genhedlaeth fod yn destun dilyniant dyfnder uchel i gael gwybodaeth ddilyniant genynnau targed. Trwy gymharu â'r treigladau hysbys a gynhwysir yn y gronfa ddata gyfeirio adeiledig (gan gynnwys catalog treiglad cymhleth Twbercwlosis WHO Mycobacterium a'i berthynas ag ymwrthedd cyffuriau), pennwyd y treigladau sy'n gysylltiedig â gwrthsefyll cyffuriau neu dueddiad cyffuriau gwrth-dwbercwlosis. O'i gyfuno â datrysiad triniaeth sampl crachboer hunan-agor macro a micro-brawf, datryswyd y broblem o effeithlonrwydd ymhelaethu asid niwclëig isel samplau crachboer clinigol (ddeg gwaith yn uwch na phroblem dulliau traddodiadol), fel y gall canfod dilyniant ymwrthedd cyffuriau fod yn wedi'i gymhwyso'n uniongyrchol i samplau crachboer clinigol.

Ystod Canfod Cynnyrch

34genynnau sy'n gysylltiedig â gwrthsefyll cyffuriau o18cyffuriau gwrth-dwbercwlosis a6Canfuwyd cyffuriau NTM, gan orchuddio297safleoedd gwrthsefyll cyffuriau; Deg math o dwbercwlosis mycobacterium a mwy na190canfuwyd mathau o NTM.

Tabl 1: Gwybodaeth am 18+6 cyffuriau+190+NTM

Mantais y Cynnyrch

Addasrwydd clinigol cryf: Gellir canfod y samplau crachboer yn uniongyrchol gydag asiant hunan-hylifedd heb ddiwylliant.

Mae'r gweithrediad arbrofol yn syml: mae'r rownd gyntaf o weithrediad ymhelaethu yn syml, ac mae adeiladu'r llyfrgell wedi'i gwblhau mewn 3 awr, sy'n gwella effeithlonrwydd gwaith.

Teipio cynhwysfawr ac ymwrthedd i gyffuriau: gorchuddio safleoedd teipio a gwrthsefyll cyffuriau MTB a NTM, sef pwyntiau allweddol pryder clinigol, teipio cywir a chanfod gwrthiant cyffuriau, cefnogi meddalwedd dadansoddi annibynnol, a chynhyrchu adroddiadau dadansoddi gydag un clic.

Cydnawsedd: Cydnawsedd cynnyrch, gan addasu i lwyfannau prif ffrwd ILM ac MGI/ONT.

Manyleb Cynnyrch

Cod Cynnyrch	Enw'r Cynnyrch	Llwyfan Canfod	fanylebau
HWTS-NGS-T001	Teipio mycobacterium a phecyn canfod gwrthiant cyffuriau (dull ymhelaethu amlblecs)	Ont 、 illumina 、 mgi 、 salus pro	16/96rxn